La canoa maratona si pratica su acqua piatta o mossa (maratona fluviale), con kayak o canoa canadese monoposto o biposto (k1-K2, C1-C2). Il percorso di gara “classico” è costituito da un campo con due giri di boa che definiscono un giro di 3-4 km, da ripetere un numero di volte variabile a seconda delle categorie, per un massimo di 30 km. Il giro prevede un tratto non navigabile (trasbordo), dove i canoisti devono scendere dalla canoa, correre per circa 100 m con barca e pagaia e reimbarcarsi velocemente.

Il percorso “short” si svolge su soli 3 giri, con manches e finale a 20 atleti.

Le maratone fluviali hanno percorsi variabili da 10 a 40 km o più, anche in più giorni, con numero e lunghezza dei trasbordi variabile, senza giri di boa.

Il Circolo organizza gare di maratona nazionali ed internazionali e le proprie squadre vi partecipano.